Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21900J3QP38 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21900J3QP38 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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