Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smim22J3QP37 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smim22J3QP37 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim22J3QP37 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms