Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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