Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Zfp616J3QN14 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Zfp616J3QN14 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Zfp616J3QN14 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Zfp616J3QN14 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Zfp616J3QN14 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Zfp616J3QN14 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Zfp616J3QN14 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zfp616J3QN14 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms