Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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