Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms