Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms