Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf148G3X9R7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms