Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28048F7BCN0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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