Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5218F6YH22 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms