Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Susd1E9Q3H4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Susd1E9Q3H4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Susd1E9Q3H4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Susd1E9Q3H4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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