Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms