Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms