Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc17E9PVB5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms