Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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