Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf217D3YYI7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf217D3YYI7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rnf217D3YYI7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rnf217D3YYI7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rnf217D3YYI7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf217D3YYI7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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