Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms