Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf518bB2RRE4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf518bB2RRE4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms