Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf1B2RRD7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms