Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phactr2B1AVP0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms