Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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