Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms