Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms