Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Odf2A3KGV1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms