Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms