Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lcn6A2AJB9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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