Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms