Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms