Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn8Q9Z260 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn8Q9Z260 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn8Q9Z260 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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