Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek4Q9Z1J2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms