Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms