Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms