Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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