Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms