Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms