Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pkd2l2Q9JLG4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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