Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nectin3Q9JLB9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms