Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trem1Q9JKE2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms