Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Riox1Q9JJF3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms