Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klhl1Q9JI74 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms