Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn2Q9ER65 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms