Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ccdc97Q9DBT3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc97Q9DBT3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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