Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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