Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slx4ipQ9D7Y9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slx4ipQ9D7Y9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms