Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms