Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chmp4cQ9D7F7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4cQ9D7F7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms