Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rtl8cQ9D6I0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rtl8cQ9D6I0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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