Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf128Q9D304 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms