Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx20Q9D2Y5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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