Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syf2Q9D198 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms