Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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